開展進料加工業務的生產企業，在第一次境外進料之前，海關核發《進料加工登記手冊》之后的第一個增值稅納稅申報期內，持進料加工貿易合同、《進料加工登記手冊》，根據實際數據填報《生產企業進料加工登記申報表》，向退稅機關辦理登記備案手續，并提供以下材料：
A. 進料加工《加工貿易加工企業生產能力證明》原件及復印件；
B. 進料加工《加工貿易業務（合同）批準證》及《加工料件備案清單》原件及復印件；
C. 《進料加工登記手冊》原件及復印件；
D. 進料加工貿易進、出口合同原件及復印件；
E. 退稅機關要求提供的其他資料。
A. 進料加工進口報關單原件及復印件；
B. 進口付款匯單復印件；
C. 退稅機關要求提供的其他資料。
生產企業應填報《生產企業免、抵、退稅進料加工免稅證明申請表》，向退稅機關申請出具免稅證明，對于采用購進法的憑當期的全部國外進料申報免稅證明；而采用實耗法的必須憑復出口貨物當期單證收齊部分為依據，核定進口料件組成計稅價以此來申報免稅證明。這一過程需提供以下資料：
A. 《進料加工登記手冊》；中進口料件報關登記表、出口成品報關登記表復印件；
B. 出口報關單原件（出口退稅專用）；
C. 出口收匯核銷單原件（出口退稅專用）；
D. 出口專用發票原件；
E. 在保稅區內倉儲出口的貨物，除提供報關單以外，還應出具保稅區倉儲企業的出口備案清單及其他規定的憑證原件、復印件；
F. 退稅機關要求提供的其他資料。
退稅機關對生產企業進料加工業務所報資料及相關電子信息審核無誤后，應在當期及時出具《生產企業免、抵、退稅進料加工免稅證明》及《生產企業出口貨物免、抵、退稅審批通知單》。
（5）進料加工手冊的核銷
生產企業《進料加工登記手冊》最后一筆出口業務在海關核銷之后的第一個增值稅納稅申報期內，憑主管海關核銷證明及核銷手冊復印件，到退稅機關辦理進料加工手冊核銷手續。如果前期審批與當期核銷存有差額，退稅機關應根據進口料件和出口貨物的實際發生情況，出具《生產企業進料加工海關登記手冊核銷申請表》，將核銷后調整的差額并入當期其他手冊進料加工出具的《生產企業進料加工貿易免稅證明》，參與當期的免、抵、退稅計算，同時，提供以下材料：
A. 《進料加工登記手冊》復印件；
B. 進口報關單、出口報關單復印件；
C. 主管海關核銷證明原件及復印件；
D. 退稅機關要求提供的其他資料。
進料加工免、抵、退稅計算
生產企業進料加工業務申請出具《進料加工貿易免稅證明》時，有兩種計算方法：一是購進計算法，指從事進料加工的生產企業在進口料件報關進口入庫后，將進口報關單進口額折合計算出海關進口料件組成計稅價格，乘以復出口貨物的征稅稅率和退稅率之差，在計算當期應納稅額時，從出口貨物不予免征、抵扣稅額中扣減。在計算當期退（免）稅額時，用海關進口料件組成計稅價格，乘以復出口貨物的退稅率，在退（免）稅額中扣減。它是按當期全部購進的進口料件組成計稅價格為依據計算出的。二是實耗計算法，指從事進料加工的生產企業在進口料件報關進口入庫且將復出口貨物出口后，根據實際耗用進料的數量和金額，計算出當期海關核銷進口料件組成計稅價格，乘以復出口貨物的征稅稅率和退稅率之差，在計算當期應納稅額時，從當期出口貨物不予免征、抵扣稅額中扣減。在計算當期退（免）稅額時，用海關進口料件組成計稅價格，乘以復出口貨物的退稅率，在退（免）稅額中扣減。它是按出口貨物當期單證齊全部分（含前期收齊單證），所耗用進料組成計稅價格依據計算出具。
進料加工"免、抵、退"稅的計算公式：
當期應納稅額＝當期內銷貨物銷項稅額－(當期進項稅額－當期不予抵扣或退稅的稅額)－上期留抵進項稅額
免、抵、退稅額＝出口貨物離岸價×外匯人民幣牌價×出口貨物退稅率－免、抵、退稅抵減額
免、抵、退稅額抵減額＝免稅購進原材料價格×出口貨物退稅率
免、抵、退稅不得免征和抵扣稅額＝當期出口貨物離岸價×外匯人民幣牌價×(出口貨物征稅稅率－出口貨物退稅率)－免、抵、退稅不得免征和抵扣稅額抵減額
免、抵、退稅不得免征和抵扣稅額抵減額＝免稅購進原材料價格×(出口貨物征稅稅率－出口貨物退稅率)
實耗法
A. 確定計劃分配率。退稅機關根據進料加工手冊中的"計劃進口總值"和"計劃出口總值"，計算確定該手冊的計劃分配率。
計劃分配率＝計劃進口總值÷計劃出口總值
計劃進口總值為進料加工手冊合同中扣除客供輔料后的進口總值。
B. 進口料件組成計稅價格的計算。
進口料件組成計稅價格＝當期單證齊全部分（含前期收齊單證）進料加工貿易出口貨物離岸價×外匯人民幣牌價×計劃分配率
C. 進口料件不予抵扣稅額抵減額的計算。
進口料件不予抵扣稅額抵減額＝當期海關核銷進口料件組成計稅價格×(征稅率－退稅率)
D. 免、抵、退稅抵減額的計算。
免、抵、退稅抵減額＝當期海關核銷進口料件組成計稅價格×退稅率
E. 進料加工手冊核銷的計算。
實際分配率＝(實際進口總值－剩余邊角余料)÷(直接出口總值＋間接出口總值＋剩余殘次成品)
實際進口總值不包括原材料調撥、進料退貨物、進料轉內銷等用紅字沖減的部分。
本手冊應開證明的免稅進口料件組成計稅價格＝進料加工直接出口總值×實際分配率
核銷手冊應補開證明的免稅進口料件組成計稅價格＝本手冊應開證明的免稅進口料件組成計稅價格－已開出免稅證明的免稅進口料件組成計稅價格
核銷手冊應補開免稅證明的進口料件不予抵扣稅額抵減額＝核銷手冊應補開證明的免稅進口料件組成計稅價格×(征稅率－退稅率)
核銷手冊應補開免稅證明的進料加工免、抵、退稅抵減額＝核銷手冊應補開證明的免稅進口料件組成計稅價格×退稅率
